Balai Pengobatan Santri dan Masyarakat (BPSM), ditangani oleh tenaga dokter profesional di bidangnya. 

 Tugas pokoknya, ialah menyelenggarakan kegiatan kesehatan di lingkungan pondok dan masyarakat, dengan membuat program dan anggaran tahunannya dengan supervisi dari pimpinan yang membidanginya.

 
Fungsi Balai Pengobatan Santri dan Masyarakat (BPSM), ialah :
  1. Menyelenggarakan kegiatan yang berhubungan dengan kesehatan.
  2. menyelenggarakan kegiatan penyuluhan yang berhubungan dengan kesehatan 
  3. Menyelenggarakan kegiatan bakti sosial kesehatan untuk kesejahteraan santri dan masyarakat.
  4. Menyelenggarakan kerja bakti untuk kebersihan, kesehatan dan lingkungan pondok dan masyarakat sekitar.